高通量聲波基因組剪切儀通過(guò)高頻超聲波產(chǎn)生的瞬時(shí)剪切力，應(yīng)用等溫、非接觸地方式對(duì)DNA樣本進(jìn)行片段化；高通量超聲波基因組剪切儀對(duì)樣品的處理具有通量高、操作靈活簡(jiǎn)便、無(wú)樣品間的交叉污染、重復(fù)性好、實(shí)驗(yàn)效率高等性能特點(diǎn)。它被廣泛用于對(duì)細(xì)菌細(xì)胞破碎、蛋白質(zhì)抽提、二代測(cè)序樣本DNA片段化、免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)等方面。
在醫(yī)療應(yīng)用領(lǐng)域，靶向治療和免疫治療的應(yīng)用越來(lái)越廣泛，通過(guò)伴隨診斷試劑檢測(cè)合適的生物標(biāo)志物，篩選出對(duì)藥物療效更加敏感的患者，可以使患者在臨床診療得到更加精準(zhǔn)的治療。因此，基于高通量測(cè)序方法進(jìn)行伴隨診斷試劑檢測(cè)的產(chǎn)品也日益增多。
聲波基因組剪切儀在高通量測(cè)序方法中的實(shí)驗(yàn)應(yīng)用方案：
1.采集樣本并對(duì)樣本進(jìn)行核酸抽提
2.DNA文庫(kù)構(gòu)建
①樣本準(zhǔn)備：基因組DNA片段化
②末端修復(fù)和連接
③Pre-PCR
④雜交和雜交洗脫
⑤Post-PCR
3.測(cè)序上機(jī)
4.數(shù)據(jù)分析和藥物靶向位點(diǎn)篩選
DNA片段化的案例展示：
DNA片段化結(jié)果圖案例1
DNA片段化結(jié)果圖案例2
高通量測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用具有高準(zhǔn)確度、高通量、高自動(dòng)化等應(yīng)用優(yōu)勢(shì)，且隨著技術(shù)不斷改進(jìn)，測(cè)序讀長(zhǎng)和測(cè)序深度也在不斷的增加，其在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用也日漸廣泛。高通量聲波基因組剪切儀可以通過(guò)可調(diào)的超聲功率與工作時(shí)間去適應(yīng)不同上機(jī)要求的片段長(zhǎng)度。
聲波基因組剪切儀用于NGS測(cè)序的優(yōu)勢(shì)：
①通量高：一次可同時(shí)處理多個(gè)組織樣品，實(shí)驗(yàn)效率高
②無(wú)需頻繁操作探頭：各樣品均在單獨(dú)的全封閉試管中，避免了交叉污染，不產(chǎn)生感染性飛霧，不需要額外插入超聲探頭
③可避免樣品的變性：采用4℃低溫水浴超聲波，能量分布均勻，超聲作用完全，樣品完全在低溫環(huán)境中進(jìn)行，避免了樣品的變性
④樣本破碎方式：利用磁致伸縮共振超聲技術(shù)破碎樣本，多種超聲頻率同時(shí)工作，能量輸出均衡，超聲密度均一，非接觸處理，確保實(shí)驗(yàn)效果一致性好
